蛋白质结构与功能分析 - 图文(3)

使用方法：在序列提交框中粘贴所需要的氨基酸序列或在“upload a file”中上传本地的序列文件→选择分析工具→点击“submit”

结果分析：

InterProScan的返回结果以

（1）图形的形式显示保守区和结构域

（2）表格的形式 显示保守区和结构域的具体位置以及蛋白家族信息和GO分类号

5、蛋白质三级结构分析

蛋白质三级结构的预测通常根据三种建模方式进行预测

（1）同源建模法分析步骤：

– 多序列比对

? 与已有晶体结构的蛋白质序列比对

– 确定是否有可以使用的模板

? 序列相似度>30%

? 序列相似度<30%，结合功能，蛋白质一级序列、二级结构或结构

域信息

– 构建三维模型

– 三维模型准确性检验

? Whatcheck 程序

? Ramachandran plot计算检验

– 手工调整多序列比对，重新拟合，构建新的模型

使用工具：SWISS-MODEL/SWISS-PdbViewer

分析方法

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