3.3 PCR验证以改良CTAB法提取的RNA进行反转录产物为模板,用18S A,18S B为引物进行PCR。实验结果表明,能成功地扩增出长度为110 bp左右的目的片段。这进一步说明本实验法提取的RNA样品完整,可以用于后续试验(见图2)。
3.4 杜鹃花 hsp70基因cDNA 核心片段的扩增采用简并引物C1和C2进行巢式PCR第1轮扩增仅得到模糊的条带,进一步采用内侧锚定简并引物D1和D2进行巢式PCR的第2轮扩增到1条约350 bp的DNA片段,与预计的目的片段相似(见图3)。回收后克隆至pMD18-T载体(TaKaRa),转化感受态DH5α,利用D1、D2引物,将通过菌落PCR反应检测得到阳性克隆进行测序,得到366bp的cDNA片段。测序后通过NCBI上的BLAST工具分析,证实为hsp70基因序列。
4 讨论
能否有效抑制RNase,去除多糖、酚叶片中含有大量的多酚,多糖,对RNA的提取方法提出了更高的要求。本实验采用CTAB(十六烷基溴化三甲胺)裂解植物材料,与细胞中的核酸形成核酸-CTAB复合体,这类复合物沉淀的时候将蛋白、多糖、色素以及多酚类化合物与核酸分离开来。利用水饱和酚可以部分去除DNA,获得DNA残留极少的RNA,减少DNA污染;同时,由于水饱和酚的加入,提高了去除蛋白质的效率,使得氯仿抽提次数在提取过程中减少,本实验中只需再进行一次氯仿:异戊醇抽提,就能使有机相与水相的界面清亮,彻底去除蛋白,避免了反复操作。
近年来已有关于去除植物组织多糖和酚类物质的相关报道,但不同植物或同一植物的不同品种往往因种属差异,材料组织内多糖或多酚的组分和含量有很大不同,所以需要采用不同的RNA提取方法。有研究表明,在高浓度Na+或K+的存在条件下,通过氯仿抽提可以去除一些多糖,经过本实验确定,与高浓度的KAc相比,高浓度的NaCl去除样品中多糖的效果更好,从而建立了有效提取样品RNA的方案。与传统CTAB法相比,本实验减少了用LiCl选择性沉淀RNA过夜的步骤,改为分级去除杂质,节省了试验时间,有利于减少RNA的降解和损耗,提高了样品的质量。
RNA plant试剂对于杜鹃花这种多酚,多糖含量都很高的材料,效果一般,可能多糖形成难溶的胶状物,与RNA共沉淀下来[7]。本实验所用的药品、试剂都较为常用,采用该方法能在一天内完成RNA的提取工作,并得到质量很高的产品,相比购买市售的RNA提取试剂盒或传统CTAB法,具有花费少、易操作、耗时短、成效高的优点。
【参考文献】
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