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生物工程实验指导2010(4)

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7.5% 6ml H2O 30%凝胶贮存液 4×分离胶缓冲液(pH8.8) 10%过硫酸铵 TEMED 3ml 1.5ml 1.5ml 60μl 3μl 10% 6ml 2.5ml 2ml 1.5ml 60μl 2.5μl 12% 6ml 2.1ml 2.4ml 1.5ml 60μl 2μl 15% 6ml 1.5ml 3ml 1.5ml 60μl 1.5μl 加入TEMED后立即混匀,小心灌入玻璃板夹层中,(胶顶距离Teflon梳子5mm左右),然后用100μl正于醇封顶,保持胶面平整。

3、灌浓缩胶:

待分离胶凝固后,倒出正丁醇和析出的水相,灌入浓缩胶,插好Teflon梳子。

4.5% 4ml H2O 30%凝胶贮存液 4×分离胶缓冲液 1ml (pH8.8) 10%过硫酸铵 TEMED 4、样品处理:

蛋白样品加入等体积的2×蛋白上样缓冲液,沸水浴5-10分钟(冷却后上样) 5、上样:

在电泳槽中加入1×PAGE电泳缓冲液,小心拔出梳子,上样10-20μl. 6、电泳:

起始用低电压8V/cm(约60V),当溴酚兰前沿进入分离胶后,电压提高位15V/cm(约120V),直到溴酚兰泳到胶底为止。关闭电泳仪。

7、剥胶:

40μl 4μl 20μl 2μl 0.5ml 2.4ml 0.6ml 2ml 1.2ml 0.3ml 4.5% 16

取出玻璃板,小心撬开,切除封底胶和浓缩胶,切去左右上角作记号。 8、染色和脱色:

将凝胶浸泡在染色液中,振荡染色1-2小时,有时可根据染色液质量,染色过夜。然后换脱色液,洗至背景干净、条带清晰为止。

9、染色和脱色:

拍照或用干胶机干胶保存。 注意:

1、SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳的有效分离范围

丙烯酰胺浓度(%) 15 10 7.5 5.0 线性分离范围(KD) 12-43 16-68 36-94 57-212 2、宿主菌都有其自身的蛋白质,表达的产物在SDS-PAGE电泳时,其分子量可能会与宿主菌的蛋白质条带重叠,给分析结果带来麻烦,遇到这种情况。一般采用以下几种办法来处理:①比较表达结果与对照结果中各条蛋白带的浓度,并选择几条肉眼看到浓度无差别的蛋白带为比较对照,寻找表达结果中是否有浓度增加的蛋白条带。如果有,则可进一步分析;②改变电泳胶的浓度(调整电泳胶的有效分辨范围),使蛋白重叠条带分开;③SDS-PAGE转膜后用抗血清或抗体做免疫western Blot(免疫印迹实验),观察表达结果中是否有特异性条带出现。

3、影响蛋白电泳的因素有:①样品的盐浓度;②SDS的质量;③缓冲液的pH值不准;④上样孔的不平整。必要是,可在拔出Teflon梳子后冲洗上样孔,以防止残留的丙烯酰胺再凝聚,造成上样孔的不平齐。

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实验四 重组蛋白纯化:可溶性His Tag-蛋白的抽提

一、实验原理

一般在大肠杆菌高效表达真核基因时,所产生的产物常以包涵体的形式存在,用超声仪破裂细菌后进行离心,表达产物存在于离心管底,而不在上清液内,因此当上清液内分析不到样品时,应考虑分析离心沉淀物,最好是第一次分析所表达的产物时,将两者同时进行电泳分析,以确定表达产物在宿主菌内的存在形式。包涵体产物一般不能直接用于常规层析方法进行纯化,必须用盐酸服等非离子型强变性剂溶解,并用不同的方法待产物复性后才能进行常规分离纯化,否则会给后期实验带来不便。

原核表达系统表达基因,其产物在宿主中的存在形式并不是固定不变的,随培养基的营养状况、诱导培养的时间和表达效果的高低而不同。如果能将表达产物变成可溶性形式,将有昨于后续实验的快速开展,表达菌培养时,营养状况好、诱导表达时间短、表达效率降低都有利于可溶性表达产物的形成。

pET28原核表达系统的表达产物C末端均融合带有His Tag序列蛋白,据此可用Novagen的His.Binda系列树脂和剂盒来纯化,其原理是通过固定化金属亲和层析(IMAC)来快速一步纯化His-Tag序列蛋白。His.Tag序列(6、8或10个连续的组氨酸残基)与固定在NTA-或IDA-的His.Bind树脂上的二阶阳离子Ni结合,洗去未结合蛋白后,用咪唑或稍低pH的洗脱液进行洗脱,从而回收目标蛋白。也可用于6M胍或尿素变性法溶解的包涵体蛋白。

二、试剂与材料

1、细菌诱导表达实验的所有器材 2、10mg/ml溶菌酶 3、10%Triton X-100

4、制冰机、高速离心机、超声波仪

5、Novagen公司的NTA-His.Binda树脂和试剂盒 6、SDS-PAGE实验的所有器材 三、操作: 1、样品准备

(1)准备细菌,接种,诱导表达。[IPTG]:lmM;37℃(或低温:30℃、24℃等);3

2+

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小时或更长时间(如过夜)。

(2)冰上冷却后离心,收集细菌,加入1/20细菌生长体积的NTA-0 Buffer,重悬;加10mg/ml溶菌酶(终浓度0.3mg/ml),冰上放置30分钟,超声破碎细菌。

(3)加入10%Triton X-100(终浓度0.1%),混匀,冰上放置15分钟,视具体情况可再次超破碎。

(4)13000rpm,离心10分钟,取上清置于冰上,准备纯化。 2、纯化

(1)将NTA树脂(一般为1ml)装入层析柱,用NTA-0 Buffer洗去乙醇。

(2)将上述的上清加到NTA层析柱中,可收集流出成分,用于SDS-PAGE分析蛋白的结合情况。

(3)用NTA-0 Buffer洗4-5次(视具体情况而定),每次1ml,洗去杂蛋白。 (4)用NTA-40 Buffer洗2次,每次1ml,其中会含有目的蛋白和杂蛋白。 (5)用NTA-100 Buffer洗4次,每次500ul,主要含有目的蛋白。 (6)用NTA-200 Buffer洗4次,每次500ul,主要含有目的蛋白。 (7)用NTA-1000 Buffer洗2次,每次500ul,主要含有目的蛋白。 3、分析

每次都要收集流出成分,取100ul样品进行SDS-PAGE分析,选取杂蛋白最少,目的蛋白最多的样品进行以后的实验。

注意:对于不同的可溶性蛋白,进行纯化的洗涤Buffer和洗脱Buffer均不同,所以在条件允许时可以用含有不同咪唑浓度的Buffer进行实验,选择最佳洗涤和洗脱条件进行纯化蛋白。

附:

NTA Buffer溶液配方

NTA-0 Buffer:20mM Tris-HCI pH7.9, 1M NaCl,10%Glycerol.

NTA-40 Buffer:20mM Tris-HCI pH7.9,1M NaCl,10%Glycerol,40mM Imidazole. NTA-100 Buffer:20mM Tris-HCI pH7.9,1m NaCl,10%Glycerol.100mM lmidazole. NTA-200 Buffer:20mM Tris-HCI pH7.9, 1M NaCl,10%Glycerol,200mM Imidazole.

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NTA-1000 Buffer: 20mM Tris-HCI pH7.9,1M NaCl,10%Glycerol, 1000mM Imidazole. NTA-树脂上海博彩公司有售

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