两步法PCR扩增标准程序:
Stage 1:预变性 95℃ 30秒 20℃/秒 1 Cycle
Stage 2:PCR反应 95℃ 5秒 20℃/秒 60℃ 20秒 20℃/秒 40 Cycles
Stage 3:融解曲线分析 95℃ 0秒 20℃/秒 65℃ 15秒 20℃/秒 95℃ 0秒 0.1℃/秒
③ 实验结果分析。
反应结束后确认Real Time PCR的扩增曲线和融解曲线,进行PCR定量时制作标准曲线等。
◆应用Smart Cycler Ⅱ System Real Time PCR扩增仪的操作方法
请按照Smart Cycler®(Cepheid公司)的使用说明书要求进行实验操作。
① 按下列组份配制PCR反应液(反应液配制请在冰上进行)。
*1 通常引物终浓度为0.2 μM可以得到较好结果。反应性能较差时,可以在0.1~1.0 μM范围内
调整引物浓度。
*2 DNA模板的添加量通常在100 ng以下。因不同种类的DNA模板中含有的靶基因的拷贝数不
同,必要时可进行梯度稀释,确定最佳的DNA模板添加量。
如果欲使用本制品进行2 Step RT-PCR反应的第二步PCR扩增反应,第一步的RT反应液作为DNA模板时的添加量不要超过PCR反应液总体积的10%。 ② 进行Real Time PCR反应。
PCR反应管请用离心机轻轻离心后放入Smart Cycler II System中进行Real Time PCR反应。建议采用下列图表显示的两步法PCR反应程序,如果该程序得不到良好的实验结果时,再进行PCR条件的优化。由于使用Tm值较低的引物等原因,两步法PCR反应扩增性能较差时,可以尝试进行三步法PCR扩增反应。有关PCR的具体反应条件请参照「实验条件的选择」。
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