③ 预变性。
预变性条件通常设定为95℃ 30 sec,使用此条件对于难变性的环状质粒DNA和基因组DNA模板也能够很好的变性。如果想改变变性条件,可以延长至1~2分钟。但是时间过长酶容易失活,不推荐使用2分钟以上的变性条件。 3. 各种试剂与反应性能间的关系如下:
TaKaRa公司有三种SYBR® Green Assay用的Real Time PCR试剂,这些试剂的反应特异性以及扩增效率间有以下关系。SYBR® Premix Ex Taq (TaKaRa Code: DRR041)是扩增效率高的试剂,但是,如果想提高反应特异性,使用SYBR® Premix Ex Taq II(TaKaRa Code: DRR081)或SYBR® Premix DimerEraser (TaKaRa Code: DRR091)则更有效。
●进行RT-PCR反应时的实验方法
进行RT-PCR反应时,使用SYBR® PrimeScript RT-PCR Kit(Perfect Real Time)(TaKaRa Code:DRR063A)更为方便。SYBR® PrimeScript RT-PCR Kit由二部分组成,即:PrimeScript RT reagents (Perfect Real Time)Kit(Perfect Real Time)(TaKaRa Code:DRR037A)和SYBR® Premix Ex TaqTM(TaKaRa Code:DRR041A,即本制品)。
这二部分试剂可以同时购买(TaKaRa Code:DRR063A),也可以单独购买。
1. 按下列组份配制RT反应液(反应液请在冰上配制)。
*1 Random 6 mers和Oligo dT Primer同时使用,可有效地将全长mRNA反转录成cDNA。
使用单引物进行反转录时,使用量分别如下: Random 6 mers(100 μM) 0.5 μl(50 pmol) Oligo dT Primer(50 μM) 0.5 μl(25 pmol) Specific Primer(2 μM) 0.5 μl(1 pmol)
*2 反应体积可按需求相应放大,10 μl的反应体系可最大使用500 ng的Total RNA。 2. 反转录反应条件如下:
37℃ 15 min(反转录反应)*3 85℃ 5 sec(反转录酶的失活反应)
*3 使用Gene Specific Primer时,建议反转录反应条件设置为42℃ 15 min。PCR反应有 非特异扩增时,将温度升至50℃会有所改善。
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