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信号通路相关文献挖掘与分析方法研究(10)

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信号通路相关文献挖掘与分析方法研究第1章绪论

根据修正后的模型的预测或假设,设定和实施新的改变系统状态的实验,重复第二步和第三步,不断地通过实验数据对模型进行修订和精练。最终目标就是要得到一个理想的模型,使其理论预测能够反映出生物系统的真实性。

系统生物学之所以不同于一般的实验生物学就在于它既需要“发现的科学”,也需要“假设驱动的科学”。然后利用“发现的科学”的方法,对系统在该条件下的所有元素进行测定和分析;在此基础上做出新的假设,然后再利用“发现的科学”研究手段进行新研究。这两种不同研究策略和方法的互动和整合,是系统生物学成功的保证。

系统生物学可以将生理现象、病理现象建立于精确的模型基础上。基因多态性图谱预测药物的疗效及其副作用,被认为是药物研发的技术平台,对医疗、制药具有深远的意义,目前全球十大制药企业已有六家设立了以系统生物学为基础的新药研发实验室。它还可以对疾病的发生机理、诊断、治疗实施监控,包括建立一个综合多种调控通路的细胞模型,为基于机理的药物发现提供系统层次的理解,辅助药物效果评估,预测副作用,发现有效控制细胞状态的手段等等。我们可以期望的发展前景是:全部基因都将知晓,以电子形式驻留在数据库中,生物学研究的出发点将是理论的,生物学家将从理论推测出发,然后再返回到实验中去,追踪或验证这些假设。药品管理部门在审查治疗药剂时需要计算机仿真的数据就像现在建筑物需要抗震的结构动力学分析数据一样。

近几年,研究方法的创新对生物学研究思维方式产生了深远影响。DNA测序、多态性检测、基因芯片、基因敲除以及蛋白质相互作用检测等技术在生物学问题上的应用,为解决生物学上从发育到人类疾病等重要问题提供了参考模型。新的方法是否已经导致新的思维方式?从某种意义上来说,答案是肯定的,因为从基因组和蛋白质组数据中推测出了一些我们以前并不清楚的结论。

1.3本文的研究概述

生物体是由一个个结构特殊、功能各异的细胞组成的复杂系统,细胞与细胞间大多有各自相对独立的内环境,但与此同时细胞们时时刻刻都在接触来自细胞内、外的各种各样信号,引发各种各样的生理反应。细胞的一切生命活动都起于信号。细胞外信号分子一般不能直接进入细胞,必须通过与胞膜表面(或胞内)特异受体结合,引发胞膜变化,产生胞内信号分子并传至胞核,从而引起基因及

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