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参薯种质遗传多样性的 I S S R分析(2)

来源:网络收集 时间:2020-12-22 下载这篇文档 手机版
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sgdfg

能稳定出现的差异带用于数据分析。1?4 聚类分析

采用Nei&Li遗传相似系数(geneticsimilarity,GS)计算各样品之间的遗传相似度,其计算公式为GS2N[(NN)+(NN)],式中NAB=11/11+0111+1011表示A和B共有的条带,N表示A有而B没有的10N表示A没有而B有的条带。遗传距离(ge?条带,01neticdistance,GD)GD=1?GS。利用NTSYS?pc(ver?sion2?10e)分析软件对数据进行分析,采用非加权配对算术平均法(unweightedpairgroupmethodarith?meticaverages,UPGMA)进行聚类分析,构建聚类图。2 结果与分析2?1 ISSR多态性水平

从41条引物中筛选出10条能够扩增出清晰、稳定条带的ISSR引物,扩增条带的相对分子量从200~1200bp不等。共扩增得到106条可区分的D

NA条带,每个引物检测到的位点在8~15个,平均每条引物可扩增出10个条带。在这106条带中,有多态性条带93条,占所观察到的总扩增带的87?7%,每个引物可扩增出6~15条多态性带,平均每条引物产生9条多态性条带,各引物检测到的多态性条带的比例从60?0%到100%(表1)。

表1 ISSR引物序列和多态性分析

引物

碱基序列扩增带数多态性带多态性率片段大小(

5′?3′)/条/条/%/bpUBC807(AG)8T99100

200~1200

UBC809(AG)8G131184.6200~1100UBC817(CA)8A12975.0100~700UBC823(TC)8C10990.0200~1100UBC825(AC)8T131292.3200~1100UBC826(AC)8C10880.0200~1100UBC829(TG)8C88100

200~1000UBC834(AG)8YT8675.0300~1100UBC842(GA)8YG8675.0300~800UBC848(CA)8

RG15

15

100

300~1200

2?2 ISSR指纹图谱构建

实验用10条ISSR引物对20个样品进行PCR扩增,建立相应的DNA指纹图谱(图1)。其中UBC823引物对山药习惯用品的DNA基因组扩增

产物的多态性最大。·3018·

图1 ISSR引物UBC809,823,848对20个样品

的扩增特征图谱

2?3 ISSR聚类分析

计算20个样品间的遗传相似系数(表2),得到参薯各样品的遗传相似系数在0?6729~0?9907,其中2号与3号样品间的相似系数最低,为0?6729,5与6号,5号与9号以及6号与7号样品之间的相似系数最高,均为0?9907;参薯与褐苞薯蓣、山薯的遗传相似系数分别在0?4579~0?5327和0?5701~0?7383。结果表明,参薯与褐苞薯蓣、山薯之间均存在较明显的差异现象,且参薯种内也具有丰富的遗传多样性。UPGMA聚类分析,得到树状图(图2,坐标显示为Nei氏相似系数),从图2可以看出,参薯16个样品可划分为4组:第1组含有2号、12号样品;第2组为1号样品;第3组含有3号、11号、4号、13号样品;其余9个样品归为第4组。参薯先与山薯进行聚类,然后再与褐苞薯蓣聚类。3 讨论

本实验采用ISSR分子标记技术分析了山药遗传多样性水平,表明3种薯蓣属植物种间存在差异;褐苞薯蓣、山薯种内遗传差异小,相似系数均在0?98以上;参薯作为产区主要的栽培品种,种内遗传差异显著,16个样品相似系数在0?6729~0?9907。  

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