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参薯种质遗传多样性的ISSR分析
?
吴志刚1,冷春鸿1,陶正明1,魏余煌2,姜程曦1
(1?浙江省亚热带作物研究所,浙江温州325005;2?瑞安市农林局,浙江瑞安325200)
[摘要] 目的:研究参薯亲缘关系和遗传多样性。方法:收集20个样品并对其原植物进行鉴定,样品进行ISSR分析,NTSYS?pc计算遗传相似系数,UPGMA方法聚类。结果:20个样品被鉴定为参薯、褐苞薯蓣、山薯。参薯与褐苞薯蓣、山薯存在明细的遗传差异,且其种内差异十分显著,遗传相似性系数为0?6729~0?9907。UPGMA聚类显示参薯种内16个样品可划分为4组,对照样品原植物表型特征,可见断面颜色及块茎支根数是评价参薯种质亲缘关系的重要依据。结论:参薯种内遗传多样性水平高,研究为山药区分提供了分子生物学依据,也为参薯新品种选育奠定了基础。
[关键词] 山药;参薯;山薯;褐苞薯蓣;遗传多样性;ISSR
山药为薯蓣属DioscoreaL?一类重要的药用植物。2005年版《中国药典》中山药基原植物规定为
[1]
薯蓣D?oppositaThunb?,药材习称怀山药。但实
2008年7月分别采于山实验材料为新鲜叶片,
20℃冷冻与硅胶干燥两种处药种植基地,样品经-理,保存备用。所有样品植物标本均经江苏省中国科学院植物研究所鉴定,其中采于乐清的1~8号与16号样品均被鉴定为参薯D?alata采于瑞安的9~
L?,采于瑞安的17号、18号样品鉴定为褐苞薯蓣D?persimilisPrainetBurkill,采于瑞安的19号、20号样品则鉴定为山薯D?fordiiPrainetBurkill。1?2 基因组DNA提取与ISSR扩增
8]
采用李明军等[山药基因组DNA的提取方法。
际上市场上山药品种多样,除怀山药外,尚有淮山(方山药)———参薯、广西淮山(广山药、珍薯)———褐苞薯蓣、广东淮山(广东山药、秤根薯)———山薯,以上3种在我国南方均有大面积栽培,分别作为浙
2?3]
。浙江南江、广西、广东等地的地方习惯山药用[
部地区历来有种植山药的传统,为参薯主产区,产区仍保留利用参薯块茎加工药材的习惯,多年栽培应
[4?5]
用历史,当地百姓又习称为“温州山药”。目前,
SpectrophotometerND?1000)检用紫外分光光度计(
测DNA浓度,1%琼脂糖凝胶电泳检测其大小和完整性,结果显示提取得到的DNA适于PCR扩增。
ISSR引物参考哥伦比亚大学生物技术实验室(UBCBL)的#9引物系列,由上海生工生物技术有限5μL,其中含基因组DNA公司合成。反应体系共2
-1
50ng,10×PCRbuffer3μL,MgCl50mmol·L,2-1-1dNTPs4mmol·L,引物0?5μmol·L,Taq酶
产区参薯、褐苞薯蓣、山薯均有栽培,特别是参薯变异大,栽培类型多。
DNA分子标记技术是研究植物多样性有效手段。国内外主要是针对山药不同品种之间的遗传差异性研究
[6]
,也有利用PCR测序技术对山药与广山
药、土山药(日本薯蓣)、方山药的18SrRNA基因序列
7]
进行测序的报道[。但迄今尚未见参薯DNA分子标
记多样性报道。因此,作者采用重复性好、稳定性好的ISSR标记技术,分析参薯种质遗传多样性,为山药资源的合理应用及优良品种的选育提供理论依据。1 材料与方法1?1 材料
[收稿日期] 2009?04?02
[基金项目] 温州市科技计划项目(N20080008);瑞安市科技计划项目(20082037)
[通信作者] ?吴志刚,Tel/Fax:(0577)88526876,E?mail:wuzhi?gang177@126?com
1?0U,ddHO补足25μL。PCR反应在MJPTC?2002PCR仪上进行,反应参数为94℃预变性5min;94℃变性1min,52~57℃退火1min,72℃延伸1?5,35个循环;72℃延伸7min。反应产物使用min
2%琼脂糖凝胶电泳分离,凝胶成像系统(PharmaciaBiotech)观察照相并记录结果。1?3 数据采集与统计分析
选取清晰可辨的电泳条带,以1和0记录条带的有无,在相同片段位置上有带记为1,无带记为0,形成0/1矩阵。对于多态性位点,仅在重复实验中
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