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靶向于流感病毒神经氨酸酶新位点的抑制剂研究进展(5)

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第2期蒋鑫等:靶向于流感病毒神经氨酸酶新位点的抑制剂研究进展

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综合评价,化合物15(图5)有望成为一个新型的H5N1禽流感病毒神经氨酸酶抑制剂。

Li等[23]把1000多个FDA批准的药物分子与N1亚型的开环构象进行了对接,然后筛选出了12个药物分子,这些药物分子都含有能够占据150-空腔的化学片段。将这些片段连接到奥司他他们设计了30个新化合物。在韦的骨架上之后,

对这些新化合物进行分子对接和分子动力学模拟

后发现,大部分化合物的结合能力接近或高于奥司他韦。化合物16~18(图5)都具有一个能占据150-空腔的取代呋喃环结构,它们的亲和力高于奥司他韦,能够与呈开环构象的N1亚型形成紧密的复合物,有希望成为一类新的N1亚型抑制剂。Wang等[24]通过筛选一个来源于NCI数据库(美国国家癌症研究所数据库)和ZINC数据库(由可购买到的化合物组成,用于虚拟筛选的免费数据库)的分子碎片库发现了一个适合150-空

N、O)将腔的分子碎片。用不同的连接原子(C、奥司他韦骨架和筛选出的碎片连接得到了化合物

19~21(图5)。分子对接结果显示,化合物19~21中的奥司他韦骨架保持了和奥司他韦类似的作用力,化合物中的碎片部分则与150-空腔形成

了氢键和疏水作用,因此,这3个化合物的亲和力

都大于奥司他韦。

[25]

化合物22和23(图5)是由D'Ursi等通过虚拟筛选得到的骨架新颖的化合物,两者的A

B环都能占据奥司他韦在活性中心的相应位置,环能很深的嵌入150-空腔,链状的接头则与Glu119和Asp151形成了氢键作用。D'Ursi等将

B环和链状接头连接在奥司他韦的C-6位上,设计了化合物24和25(图5)。对接研究结果显示,这两个化合物的奥司他韦部分位于酶的活性中

B环能够占据150-心,空腔,接头也能与Glu119和Asp151形成氢键,且二者的结合能力也比原来的化合物有所增强。

化合物26(图5)是从约230000个化合物中筛选得到的,它能明显地抑制H5N1和H1N1流感病毒的复制。虽然其酶活性不如奥司他韦,但它对奥司他韦具有协同效应。分子对接显示,化合物26能与N1亚型神经氨酸酶的开环构象相150-并与V116、环的R156和430-环的结合,T439等“热点”氨基酸残基形成氢键。而且它的因此它也许能和奥司结合模式与奥司他韦不同,

[26]

他韦或者扎那米韦同时结合于神经氨酸酶。

Figure5Structuresofcompounds12-26

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