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靶向于流感病毒神经氨酸酶新位点的抑制剂研究进展(3)

来源:网络收集 时间:2020-11-29 下载这篇文档 手机版
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N4、构可以分为两组:第1组神经氨酸酶包括N1、

N5和N8亚型;第2组神经氨酸酶包括N2、N3、N6、N7和N9亚型。在2006年之前,只有第2组的N2亚型和N9亚型的晶体结构被解析出Russell等[10]发表了第1组的来。2006年,

N1、N4和N8亚型的晶体结构。这3种亚型的

但是,当把这3种亚型的活性中心是相同的,

活性中心与第2组神经氨酸酶的活性中心比

较时,他们发现这两组神经氨酸酶活性中心的结构有明显不同。

这两组神经氨酸酶活性中心结构的不同主要体现在150-环(147~152位氨基酸残基)和150-空腔上。如图3所示,第1组神经氨酸酶的Val149与第2组神经氨酸酶的Ile149有大约7?的距离,并且Val149的疏水侧链指向活性中心之外,而Ile149的疏水侧链指向活性中心之内。两组神经氨酸酶的151位都是一个天冬氨酸残基,但两组神经氨酸酶Asp151侧链的位置有1.5?的不同。与Asp151邻近的Glu119在两组酶之间具有不同的构象,第2组神经氨酸酶的Glu119与Arg156形成了一个氢键,而第1组酶Glu119的羧基则指向近于相反的方向

象与奥司他韦结合,在经过一个相对缓慢的构象变化之后,最后以150-环的“关闭”构象与奥司他“开放”韦结合。150-环在构象时的能量低于其在“关闭”构象时的能量。而第2组神经氨酸酶一“关闭”直保持150-环的构象。

Amaro等[11]发现通过分子动力学模拟研究,

150-环比在晶体结构中观察到的更具有柔性,它能够打开得更宽。这个过程通常与相邻430-环向外的运动同时进行,这使酶的活性中心明显扩大。

Landon等[12]应用分子动力学方法和计算溶剂映射分析法,在150-环和430-环区域发现了新“热点”区域。这些“热点”区域可以用来设计的

具有更高亲和力的新型神经氨酸酶抑制剂。

Wang等[13]最近解析了N5亚型的晶体结构,并且发现N5亚型的神经氨酸酶也有一个150-空腔。与第1组神经氨酸酶的其他亚型相N5的150-比,空腔更大,这主要是因为N5亚型具有更大的150-环。和第1组神经氨酸酶的其N5亚型的150-他亚型相同,环在与抑制剂结合后也关闭。

2新型神经氨酸酶抑制剂

神经氨酸酶在流感病毒复制周期中的关键作

用及其活性中心在不同流感病毒亚型之间的高度

使其成为抗流感病毒药物设计的理想靶保守性,

点。由于传统的神经氨酸酶抑制剂均基于第2组

神经氨酸酶的晶体结构设计得到,第1组神经氨酸酶150-空腔等结构的发现为基于结构合理设计新型神经氨酸酶抑制剂(特别是第1组神经氨酸酶选

[10-12]

。目前,择性抑制剂)提供了机会已被报道的

相关研究主要集中在以下两个方面:1)对现有抑制

Figure3ComparisonoftheactivesitesofN1

andN9NAs[10]

剂进行结构修饰以靶向新的结合位点;2)通过基于结构的虚拟筛选技术发现新化学分子。2.1

对现有抑制剂进行结构修饰以靶向新的结

[14]

以上150-环结构的不同使第1组神经氨酸酶

的活性中心附近出现了一个较大的空腔(150-空腔),而第2组神经氨酸酶则不存在这个空腔。150-5?的宽度和5?空腔大约有10?的长度、的深度。第1组神经氨酸酶的Asp151和Glu119特定位置不仅使该组酶活性中心的宽度增加了

5?,而且使酶的活性中心能与150-空腔相通。当与奥司他韦等抑制剂结合时,第1组神经

“开放”“关闭”氨酸酶的150-环存在和两种构象。第1组神经氨酸酶开始时以150-环的“开放”构

合位点

Wen等设计并合成在分子对接的基础上,

了一系列扎那米韦衍生物作为第1组神经氨酸酶的选择性抑制剂。在该系列化合物中,化合物7(图4)的活性最好(IC50=2.15μmol·L-1,EC50=0.77μmol·L-1),但是仍低于扎那米韦。分子模拟研究表明,化合物7胍基上的侧链能与150-环产生额外的作用力。然而该作用力却使胍基和活性中心S2区域的氢键作用减弱,这是化合物7活性降低的原因。

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