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2006-06-03 | VASP安装过程全记录
最近一直在安装VASP,积累了不少东西。现在总结如下: 1.安装linux
由于不熟悉linux的操作,所以很多问题无法解决,所以直接在windows下面安装了虚拟机然后安装linux操作系统。 (1) 虚拟机的安装
我所使用的是VMware,安装过程同普通的windows下软件的安装。 下载地址:www.VMware.com或者www.VMware.cn (2) VMware配置linux,过程如下:
a)选择File菜单下的“New Virtual Machine”出现新虚拟机向导后单击“下一步” 选择“Typical”典型安装。
b)再单击“下一步”,在选择操作系统界面的“Guest Operation System”中选择
“Linux”,然后单击Version对应的下拉菜单选择具体的Linux版本,此处我选择的是“Red Hat Linux”。
c)单击“下一步”进入安装目录选择界面。该界面上面的文本框是系统的名字,保持默认值即 可,下面的文本框需要选择虚拟机操作系统的安装位置。
d)根据需要选择好后,单击“下一步”按钮,出现设置虚拟机内存大小的界面。Linux9.O对 内存的要求是:文本模式至少需要64MB;图形化模式至少需要128MB,推荐使用192MB。我选 择的是192MB。
e)单击“下一步”按钮进入网络连接方式选择界面。VMware有四种网络设置方式,一般来说, Bridged方式使虚拟机就像网络内一台独立的计算机一样,最为方便好用(四种连网方式的区 别可参考VMware的有关资料)。此处我选择Brided方式。
f)单击“下一步”按钮进入虚拟磁盘的设置界面。 这里有三种方式(Create a new virtual disk、Use an existing virtual disk、Use a physical disk)可供选 择、建议初学者选择“Create a new Virtual disk”,其含义是新建一个虚拟磁盘,该 虚拟磁盘只是主机下的一个独立文件。
g)在“下一步”中设置磁盘大小。在此、我们采用默认的4GB。 h)单击“下一步”进入文件存放路径选择界面。
在此界面可单击Browse按钮进行设置。此处我们使用默认值,单击“完成”按钮。 至此,完成一个虚拟机的配置。 (2) VMware下linux的安装
安装前需做好准备工作:购买一套Red Hat Linux 9.0的安装盘, 共三张。或下载Red Hat Linux 9.0安装所需要的三个ISO文件。由于我的电脑配置问题,直接在光驱下安装linux速度比较慢,所以我使用ISO镜像文件安装。 过程如下:
a)安装第一张虚拟光盘
(如果直接用光盘安装,可省去此步及后述的第五步。直接将光盘插入物理光驱即可) 选择VM菜单下的Settings选项,单击比Hardware选项卡下的CD—ROMl,在右边的 “connection”单选按钮组中选择“Use ISO image”。按“Browse”选择3个光盘文件中的
第一个,然后按“OK”。 b)启动虚拟光驱
点击工具栏上的绿色启动按钮或屏幕显示区的start this virtual machine命令,然后 按“ok”。RED HAT会自动进入安装程序的界面。首先询问的是以图形界面还是以文本界面安
装,依据提示按回车选择图形界面安装,接下来询问是否要测试光驱,这里选择不要即可。 方法是:在VMware窗口上单击一下鼠标(实现从windows切换至VMware),再按键盘上的TAB
键,然后按空格。
注意:光标从Windows切换到VMware只需在VMware窗口上单击鼠标左健,而从VMware回到
Windows,则要按Ctrl十Alt。提醒大家的是,在对虚拟机进行操作前一定要确保光标在 VMware中。 c)设置分区
依提示选择完安装语言、键盘、鼠标、安装类型(与Windows类似,此处不再详述)后进入
磁盘
分区界面,此时会出现警告,既然是在虚拟机上进行的操作,此处大胆地选“是”就可以在 接下来的窗口中一路默认连按“下一步”后,弹出“你已选择了要在—F列驱动器内删除所有 分区??”的警告,选择“是”进入引导程序装载界面。 d)设置口令
在引导程序装载界面连按“下一步”。设置完系统语言和时区后进入根口令的设置界面,这
里的根口令相当于Windows 2000的系统管理员密码。设置好口令后连按“下一步”,等待安 装软件包,直到出现更换光盘的提示。
e)安装第二张和第三张光盘
设置方法同1,只不过是分别选择3个光盘文件中的第二、三个。第三张盘读完后,系统问是
否做启动盘,这个根据自己需要选择,然后就是显卡等的设置,一路默认。最后选一个“退 出”,VMware内系统重启。
f) 创建个人用户账号和密码
重启后,系统提示你创建一个个人账号和密码,和Windows中创建一个新用户相当。 g) 其它设置
选择日期和试听声卡后问你是否注册,选择“否,我不想注册我的系统”,接下来问 有无附加安装,在此我们先不安装,直接按“前进”。VMware内系统再次重启。 h) 登录系统
启动后。系统询问用户名和密码。
输入在步骤6中设置的户名和密码或输入用户名“root”和第4步中你所设置的根口令
即可。
至此,出现Red Hat 9的界面,Linux的安装完成了。 (以上参考自《中小学信息技术教育》) (4) VMware下windows和linux共享文件的方法
由于VASP和很多数据库的安装文件是保存在windows下面的,而linux对有些U盘并不容易识别,所以最好能使linux使用windows下面的文件。
共享的方法有很多,但是由于本人是初学者,所以只介绍自认为比较容易掌握的方法: A. 用VMware tools 工具
首先安装VMware tools,点击setting VMware tools install
之后linux下会弹出cdrom的文件夹,里面有两个tar包,解压。然后在终端里进入cdrom的文件夹,键入./install(注意前面的“.”)。
安装好VMware tools 后,点击edit virtual machine settings option sharedfolders add,然后选择路径,加入相应windows下的文件,最后点击enable就可以了。
回到linux下,此时在/mnt就会多一个/hgfs的文件夹,共享的文件就在/hgfs下。
B. 用ISO文件
将文件制成ISO文件(刻录软件大概都可以,例如nero或者NTI-maker),然后在将cdrom的路径改为使用ISO文件,再在linux下挂载cdrom就可以读入文件了。 2.安装PGI编译器
PGI编译器是要收费的,可以先下载一个有15天试用期的安装文件。下载的pgi编译器tar文件,还要有一个license.dat的文件,将文件放在/usr/local/pgi下。 在pgi文件夹下,首先解压pgi文件,在终端输入:
tar xzvf pgi.tar.gz(注:pgi代表下载的pgi文件名,有时候会带后缀) ./install 在主目录下:
vi .bashrc(注:不要忘了bashrc前面的“.”) 在最后加入如下四行: export PGI=/usr/local/pgi
export PATH=$PGI/linux86/5.1/bin:$PATH(注:此处有的文件是5.2,我下载的是5.1) export MANPATH=$MANPATH:$PGI/linux86/man export LM_LICENSE_FILE=$PGI/license.dat 3. VASP4.6版本的安装(转自2008的博客) 将所有的文件放在/home/***/vasp下
(1)需要的文件:vasp.4.6.tar.gz,vasp.4.lib.tar.gz 数学库:LAPACK、ATLAS和PGI
(2)下载ATLAS(http://math-atlas.sourceforge.net),在终端下输入: tar xzvf atlas.tar.gz
在ATLAS目录下的lib中的libatlas.a,libcblas.a,libf77blas.a,liblapack.a是所需的文件。
(3)解压vasp.4.6和vasp.4.lib: tar xzvf vasp.4.6.tar.gz tar xzvf vasp.4.lib.tar.gz (4)进入vasp.4.lib
cp makefile.linux_pg makefile make
若安装过程中出现libdmy.a is up to date则输入:
rm *.o
然后每次出现询问是否删除×××.o的文件时依次输入y按回车键 最后make
(5)进入vasp.4.6目录下,在终端输入: cp makefile.linux_pg makefile vi makefile 将第129行改为:
ATLASHOME=/home/×××/vasp/ATLAS/
然后按Esc键,输入:wq,用来保存修改过的文件。 然后在终端中输入:touch *.F,更新修改过的文件。 make
得到的vasp执行文件即为所用文件了。
我在安装过程中出现了can not find lcblas的问题,对此的解决至今还在查找中。
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